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Nature Commun | 廣西醫科大學唐安洲/何光耀/李超乾團隊繪制樹鼩免疫細胞圖譜

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在免疫學研究中,小鼠、大鼠等嚙齒類動物模型雖被廣泛使用,但其免疫系統與人類存在顯著差異,無法完全模擬人類疾病過程。例如,小鼠對肝炎病毒、皰疹病毒乃至新冠病毒的天然不敏感性,限制了其在相關感染研究中的應用。非人靈長類動物雖更接近人類,但受限于倫理、成本和可及性。因此,科學界一直在尋找一種兼具嚙齒類動物便利性與靈長類動物生物學相關性的小型動物模型。樹鼩,這種親緣關系上接近靈長類的小型哺乳動物,正是一個充滿潛力的候選者。

2026年3月11日,廣西醫科大學第一附屬醫院唐安洲教授、何光耀教授及李超乾教授團隊在《自然·通訊》(Nature Communications)期刊上發表了題為《Tree shrew immune cell atlas identifies NR1H3+ tissue macrophages with conserved antiinflammatory function》(樹鼩免疫細胞圖譜鑒定出具有保守抗炎功能的NR1H3+組織巨噬細胞)的研究論文。該研究通過單細胞轉錄組技術,系統性繪制了樹鼩12個組織、39種細胞類型的免疫圖譜,為這一新興模式動物在免疫學研究中的應用奠定了重要基礎。


研究團隊首先對成年樹鼩的12個組織(包括脾臟、淋巴結、扁桃體、肺、肝、腎等)進行了單細胞及單細胞核RNA測序,共獲得近19萬個高質量細胞,構建了全面的單細胞免疫圖譜。令人矚目的是,他們發現樹鼩擁有與人類相似的扁桃體結構,包括腭扁桃體和咽扁桃體,其中存在完整的B細胞、T細胞及生發中心,而這一結構在嚙齒類動物中幾乎缺失。進一步分析顯示,不同組織中的巨噬細胞呈現出高度特化的轉錄組特征:肝臟巨噬細胞富集代謝相關通路,心臟巨噬細胞則與心肌收縮相關。在脾臟中,團隊鑒定出兩個功能迥異的巨噬細胞亞群——具有免疫抑制特征的NR1H3+巨噬細胞和具有促炎特征的IRF8+巨噬細胞。在急性EB病毒感染模型中,NR1H3+巨噬細胞發生了顯著的炎性重編程,NR1H3表達下調,伴隨IL1B、TNF等促炎因子及補體成分的上調,同時成為細胞間信號通訊的核心樞紐。


為驗證這一發現的保守性與轉化潛力,研究團隊整合了包括人類、獼猴、豬、大鼠、小鼠及斑馬魚在內的七種脊椎動物的脾臟巨噬細胞單細胞數據。跨物種分析顯示,樹鼩的巨噬細胞轉錄組介于嚙齒類與靈長類之間,其NR1H3表達水平及調控網絡與人類高度相似。在人類THP-1巨噬細胞系及原代單核來源巨噬細胞中,過表達NR1H3或使用NR1H3激動劑可顯著抑制LPS誘導的IL-1β、TNF-α等炎癥因子釋放,并抑制非經典NF-κB通路。Cut&Tag實驗進一步證實,NR1H3可直接結合在TNFSF14、NFKB2等免疫調控基因的啟動子區域,發揮轉錄抑制作用。這一機制在樹鼩與人類之間高度保守。綜上,該研究不僅提供了樹鼩免疫系統的單細胞參考圖譜,更揭示了NR1H3+巨噬細胞作為免疫調控關鍵節點的保守機制,有力支持樹鼩作為連接嚙齒類與靈長類之間的互補性動物模型,用于人類炎癥性疾病與感染免疫研究。

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