撰文|徐思遠(yuǎn)
審閱|藍(lán)賢江
近日,復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院青年研究員藍(lán)賢江課題組在Oncogene上在線發(fā)表題為Dual function of DOT1L suppresses tumor cell-intrinsic immunogenicity in hepatocellular carcinoma的研究長文,揭示了組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶DOT1L通過抑制轉(zhuǎn)座子元件的染色質(zhì)可及性和轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而抑制腫瘤細(xì)胞內(nèi)在干擾素信號(hào)通路的分子機(jī)制。該成果不僅為肝癌免疫治療提供了新的潛在靶點(diǎn),還提出利用DOT1L臨床前抑制劑EPZ-5676聯(lián)合PD-L1抗體的靶向治療新策略。
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對(duì)于許多癌癥,免疫檢查點(diǎn)抑制劑( ICB )療法在患者總體 響應(yīng) 率方面 仍然 非常 有限 。該研究利用靶向表觀遺傳因子的 CRISPR/Cas9 文庫篩選技術(shù),在肝細(xì)胞癌( HCC )中 創(chuàng)新性的 以 雙 免疫檢查點(diǎn) PD-L1 和 CD47 作為報(bào)告基因,確定 DOT1L 是一種多功能的表觀遺傳因子,其通過雙重機(jī)制發(fā)揮抑制腫瘤內(nèi)在免疫 原性 的作用。
具體 而言 ,研究者利用 CRISPR/Cas9 基因篩選和 RNA-seq 實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)并確定 DOT1L 缺失會(huì)引發(fā)腫瘤細(xì)胞內(nèi)在的免疫反應(yīng),并使細(xì)胞對(duì) IFNγ 的反應(yīng)性增強(qiáng),從而激活 CD47 和 PD-L1 的表達(dá)。進(jìn)一步將 DOT1L 抑制劑 EPZ-5676 與酶活催化位點(diǎn)的挽救實(shí)驗(yàn)相結(jié)合,證明了 DOT1L 甲基轉(zhuǎn)移酶活性對(duì)于抑制細(xì)胞內(nèi)在免疫反應(yīng)至關(guān)重要。
在機(jī)制上,研究者首先揭示了 DOT1L 的抑制功能。利用 total RNA-seq 、 ChIP -seq , ATAC-seq 等測(cè)序?qū)嶒?yàn),發(fā)現(xiàn) DOT1L 缺失導(dǎo)致基因組中逆轉(zhuǎn)錄元件 TEs 的染色質(zhì)可及性和轉(zhuǎn)錄增加;進(jìn)一步利用 J2 流式細(xì)胞術(shù)和 dsRNA senor ( MDA5/RIG-1 )挽救實(shí)驗(yàn),證明 DOT1L 的缺失會(huì)導(dǎo)致免疫原性雙鏈 RNA 的積累,進(jìn)而引發(fā) I 型干擾素通路;利用 fanChIP 實(shí)驗(yàn)證明 DOT1L 可以直接或間接抑制 TEs 的染色質(zhì)狀態(tài)和轉(zhuǎn)錄。另一方面,研究者通過多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析發(fā)現(xiàn) DOT1L 以 H3K79me2 依賴的方式直接激活 ZEB1 轉(zhuǎn)錄,從而進(jìn)一步抑制免疫相關(guān)基因的表達(dá),這表明 DOT1L 在人 肝癌 細(xì)胞 中 發(fā)揮 雙重 功能 。
在轉(zhuǎn)化方面,利用 C57BL/6 小鼠模型,證明了 Dot1l 缺失或使用抑制劑 EPZ-5676 會(huì)誘導(dǎo)干擾素通路激活使腫瘤浸潤免疫細(xì)胞增多,對(duì) ICB 治療更敏感。此外,在免疫系統(tǒng)人源化小鼠腫瘤模型中,僅通過 EPZ-5676 抑制 DOT1L 活性就足以增強(qiáng)抗腫瘤免疫。
最后,研究者整合了多個(gè)已發(fā)表的癌細(xì)胞系轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)和 TCGA 數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn) DOT1L 的表達(dá)與干擾素特征相關(guān)基因呈 顯著 負(fù)相關(guān),這表明 DOT1L 可能是多種癌癥類型中的新型腫瘤標(biāo)志物。
綜上,本研究系統(tǒng)闡明了一條 DOT1L-TEs-dsRNA-IFN 信號(hào)通路激活的級(jí)聯(lián)調(diào)控軸,不僅拓展了 DOT1L 穩(wěn)態(tài)調(diào)控的理論框架,也為靶向 DOT1L 以提高腫瘤免疫原性并克服免疫治療耐藥性提供了理論依據(jù)。
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DOT1L 工作模型
本文的第一作者為復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院已畢業(yè)博士生徐思遠(yuǎn),復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院的藍(lán)賢江研究員和復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院蔡加彬副主任醫(yī)師是該論文的通訊作者。本項(xiàng)目研究得到了復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究員羅敏研究員和藍(lán)斐研究員,復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士的大力支持和幫助。
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41388-026-03744-6
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