基因組長達數百萬乃至數十億個堿基,難以一次性完整讀取,需打斷為小片段后測序、拼接、比對,最終重構出完整的序列信息。根據測序平臺的不同,文庫構建策略可分為二代測序(短讀長)與三代測序(長讀長)兩大類。三代測序因讀段更長,在檢測復雜結構變異、串聯重復序列及 DNA 甲基化等方面優(yōu)勢顯著,廣泛應用于遺傳病、腫瘤研究等領域。但其成本高、通量有限,靶向富集特定區(qū)域成為平衡成本與數據深度的關鍵策略。
如何將成熟的二代靶向捕獲方案,運用至三代測序平臺?如何在一次實驗中同步獲取甲基化信息與全長轉錄本數據?如何從微量樣本出發(fā),實現高效、高覆蓋的靶向三代測序?
4 月 16 日 14:00~16:00,安捷倫帶來題為「跨越壁壘,解鎖三代測序新應用」的線上主題講座,特邀東京大學 Masahide Sato 教授,他將以詳細的濕實驗驗證數據與生信分析結果,展示該技術如何在癌癥耐藥機制研究、表觀遺傳分析(甲基化檢測)、全長轉錄本測序、以及微量樣本(低至 10 ng gDNA)的靶向測序等場景中實現突破性應用,為三代測序在復雜疾病研究中的落地提供切實可行的方案。現在報名,還有機會贏取 Tomtoc 電腦包,充電兩用護眼臺燈,定制 U 盤等 80 份好禮!
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這些突破性應用得以實現,離不開穩(wěn)定可靠的工具 :
SureSelect 靶向捕獲系統(tǒng):經實驗驗證的跨平臺(二代/三代)富集工具
安捷倫 SureSelect XT HS2 靶向富集系統(tǒng)基于液相雜交捕獲原理,其探針原本為短讀長測序平臺設計。通過簡單調整實驗操作,無需重新設計探針即可用于長片段靶向捕獲,顯著降低方法開發(fā)成本。優(yōu)化后可獲得插入片段長度約 5 kb 的靶向序列捕獲文庫,在納米孔測序中展現出良好的靶標命中率與覆蓋度。無論是 DNA 甲基化靶向測序,還是空間轉錄組靶向分析,SureSelect 均提供從樣本制備、探針定制到數據分析的一體化解決方案,助力科研人員突破二代測序瓶頸,解鎖三代測序的深層應用。
「NGS 靶向捕獲測序雖已廣泛應用于臨床遺傳病診斷過程中,但受限于短讀長的先天不足,對許多疾病變異位點尚不能進行準確檢測,需要配合其他技術進行補漏,比如脆性 X 綜合征這類以短串聯核苷酸重復擴增引起的疾病,以及 α 地貧這類受同源序列嚴重干擾的疾病。長讀長測序可以有效解決 NGS 在檢測這些變異時的不足,提高檢測效率和臨床獲益,非常期待基于此技術的 WES 應用報告。」
--安捷倫基因組學產品經理
「短讀長目標區(qū)域捕獲測序已經成熟應用超過 15 年,隨著三代測序(長讀長)測序技術越來越成熟,針對長讀長的目標區(qū)域捕獲測序的需求也日益顯現,尤其是長讀長目標區(qū)域捕獲測序能夠解決一些短讀長測序解決不了的問題,如串聯重復區(qū)域或者相關基因的測序與拼接檢測,結構變異,目標全長轉錄本的測序與拼接等,該應用簡報提供了一種基于 Agilent SureSelect 目標區(qū)域捕獲技術方案優(yōu)化的針對長讀長的目標區(qū)域捕獲測序方法,為相關臨床研究及科研工作者提供了有利的技術方法。」
--安捷倫基因組學應用工程師
內容策劃:沈佳鈺
內容審核:朱曉芳
題圖來源:圖蟲創(chuàng)意
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