2025年9月18日，斯坦福大學(xué)Alistair Nicol Boettiger團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種名為TRACK-IT技術(shù)。該技術(shù)通過在染色體上插入自定位的熒光標(biāo)簽，并在超高分辨率下對(duì)這些標(biāo)簽進(jìn)行成像，從而能夠觀察基因組在不同時(shí)間尺度上的運(yùn)動(dòng)。相關(guān)內(nèi)容以“Kinetic organization of the genome revealed by ultraresolution multiscale live imaging”為題發(fā)表在《Science》上。

近日，Science編輯團(tuán)隊(duì)和作者在文章發(fā)表后已被告知，作者提供的數(shù)據(jù)和代碼與論文中報(bào)告的分析及結(jié)果之間存在潛在不一致。我們正與作者合作，以確定適當(dāng)?shù)奶幚矸桨福瑫r(shí)在此提醒讀者注意上述問題——此舉已征得作者同意。

數(shù)據(jù)真實(shí)性再遭質(zhì)疑：三維追蹤被指實(shí)為二維，近800萬數(shù)據(jù)點(diǎn)“失蹤”

據(jù)了解，相關(guān)質(zhì)疑人員在嘗試使用作者上傳至Zenodo的數(shù)據(jù)復(fù)現(xiàn)論文部分圖表時(shí)，發(fā)現(xiàn)了異常情況。盡管利用這些數(shù)據(jù)大致能夠重建論文的主要圖表，表明其確實(shí)（如預(yù)期那樣）被用于制作關(guān)鍵結(jié)果，但在深入分析數(shù)據(jù)后，質(zhì)疑人員發(fā)現(xiàn)，所謂的追蹤數(shù)據(jù)實(shí)際上大部分屬于二維距離軌跡。

由于能夠使用作者上傳的數(shù)據(jù)復(fù)現(xiàn)關(guān)鍵圖表，且這些數(shù)據(jù)本質(zhì)上是二維距離信息，這意味著作者聲稱使用了三維距離追蹤數(shù)據(jù)的說法并不成立。質(zhì)疑方指出，除非這一矛盾能夠得到實(shí)質(zhì)性解釋，否則論文的結(jié)論將失去基礎(chǔ)——因?yàn)槠浜诵囊蕾囉趯?shí)際并不存在的三維位置信息。因此，作者有必要對(duì)此作出澄清；若無法提供合理解釋，該研究的主要主張將缺乏依據(jù)，論文應(yīng)予以撤回。

盡管作者已作出回應(yīng)，但新的質(zhì)疑接踵而至。質(zhì)疑人員進(jìn)一步指出，Zenodo上標(biāo)注為“v2”的數(shù)據(jù)集存在兩個(gè)問題：其一，發(fā)布日期標(biāo)注不實(shí)——頁面顯示為2025年9月18日，但技術(shù)元數(shù)據(jù)顯示實(shí)際創(chuàng)建于2025年12月24日；其二，數(shù)據(jù)量嚴(yán)重不符——論文中稱擁有超過1800萬個(gè)三維距離測量數(shù)據(jù)點(diǎn)，而Zenodo v2僅包含約1045萬個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)，缺失近800萬個(gè)。

質(zhì)疑者已明確要求作者上傳論文實(shí)際使用的數(shù)據(jù)，而非當(dāng)前提供的不一致數(shù)據(jù)集。截至目前，作者方面尚未就上述最新質(zhì)疑作出進(jìn)一步回應(yīng)。