了解國家體育總局機構設置的朋友應該都知道，目前國家體育總局一共設立有21個正廳局級的運動管理中心（均為事業單位性質），具體涉及到了“冬季運動、射擊射箭運動、自行車擊劍運動、水上運動、舉重摔跤柔道運動、拳擊跆拳道運動、田徑運動、游泳運動、體操運動、手曲棒壘球運動、籃球運動、排球運動、乒乓球羽毛球運動、網球運動、小球運動、航空無線電模型運動、棋牌運動、武術運動、健身氣功、登山運動和汽車摩托車運動”。但細心的人看到這里也許就發現了，在這21個正廳局級的運動管理中心中，竟然沒有“足球運動管理中心”。

但實際上呢，在2016年2月之前，國家體育總局其實是設有足球運動管理中心的，而且規格級別也是正廳局級。根據公開資料顯示，國家體育總局足球運動管理中心的前身是原中華人民共和國體育運動委員會足球處（簡稱“國家體委足球處”）。

1995年1月3日，足球運動管理中心正式宣布成立，其機構性質為國家體委直屬事業單位，也是中國足球協會的常設辦事機構，被賦予對足球運動項目全面管理的職能，后于1998年4月6日伴隨著國家體育總局的成立而更名為國家體育總局足球運動管理中心。國家體育總局足球運動管理中心與中國足球協會實行"兩塊牌子、一套人馬"的組織架構，內設綜合部、外事部、聯賽部、技術部、青少年發展部、女子足球管理部等六個處級部門，主要職責包括制定足球發展規劃、管理國家隊及競賽事務，并負責中國足球學校的管理工作。

不過，早在2015年3月的時候，當時國務院下發了《中國足球改革總體方案》，根據《方案》要求：足協去行政化并與體育總局脫鉤，不設行政級別。對此，當時有多家官方媒體解釋稱：“管辦分離”改革為的就是改變中國足協與體育總局足管中心“兩塊牌子、一套人馬”的組織構架，讓中國足協與體育總局脫鉤，從而在內部機構設置、行業管理建設等方面擁有更大的自主權和靈活性。

于是，伴隨著足球領域的“管辦分離”改革，國家體育總局原足球運動管理中心先是在2016年2月16日由中央編辦撤銷了足球中心事業單位建制，后又于2017年1月5日在國家事業單位登記管理局正式完成注銷流程，這也就意味著中國足協與國家體育總局脫鉤并成為獨立的社團法人，以社團法人身份獨立管理足球事務。

現階段，中國足球協會（簡稱“中國足協”）作為由國內致力于足球事業發展的組織和個人自愿結成的，具有公益性和代表性、專業性的全國性、行業性社會團體，接受業務主管單位即國家體育總局和登記管理機關即民政部的業務指導和監督管理，同時也是中華全國體育總會的單位會員、是中國奧委會承認的全國性單項體育協會，也是代表中國加入國際足聯和亞足聯唯一合法機構，根據法律授權和政府委托管理全中國的足球事務。

在領導班子構成方面，中國足協的領導班子由黨委書記、主席、紀委書記、副主席等構成，其中現任中國足協黨委書記由國家體育總局分管副局長兼任。在組織機構方面，中國足協設立有秘書處（秘書長一職現由中國足協副主席、黨委副書記袁永清兼任），中國足協秘書處下設“黨群工作部（人力資源部）、綜合和財務管理部、國家隊管理部、女子足球部、青少年足球部(全國足球發展重點城市辦公室)、社會足球部、技術部（技術總監辦公室）、競賽部、裁判部、對外交流部、媒體文化部、數字信息部和紀檢監督部”。

此外，中國足協還下轄中國福特寶足球產業發展公司、國家足球訓練基地這兩個直屬機構，其中“福特寶”公司在1993年成立于北京，是經國務院經貿委批準成立的中國足球協會直屬國有企業（享有以中國足協中國之隊、中國足協杯賽、中國足協超級杯賽為代表的中國足協多項賽事及活動的商務開發權，現為我國規模最大、體系最為完善的足球產業公司）。而國家足球訓練基地(中國足協訓練基地)位于河北省香河縣境內，距離北京60公里，總占地面積約200畝，建筑面積2萬平方米，投資總額8500萬人民幣。

而根據工作開展需要，中國足球協會還設有相應的專項委員會，各專項委員會是中國足協分支機構，在授權范圍內依據工作規范協助執委會處理本會專項事務。中國足協專項委員會有紀律與道德委員會、糾紛解決委員會、新聞委員會、技術委員會、裁判委員會、青少年委員會、運動員委員會等等。

目前，中國足協所轄會員協會共計有53家，其中省級協會32家(含4個直轄市和新疆生產建設兵團足協)、重點城市協會13家以及行業單位協會8家(具體分別是煤礦體協、火車頭體協、中國學體聯、企業體協、公安體協、軍體訓練中心、中足聯和電力體協)。