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Cell?|?雷曉光/閆建斌合作破解三尖杉抗癌天然藥物生物合成難題

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三尖杉類生物堿與高刺桐 類 生物堿是 三尖杉中 結構獨特、活性顯著的天然產物, 其中 高三尖杉酯堿 是 2012年被美國FDA批準的 治療慢性粒細胞白血病的臨床一線藥物,在全球血液腫瘤治療領域發揮著不可替代的重要作用。然而三尖杉屬于珍稀瀕危植物,天然植株內目標生物堿含量極低,依靠傳統采摘提取、化學半合成的生產模式不僅效率低下,還嚴重威脅野生植物種群安全。半個世紀以來,全球科研人員持續攻關,兩類生物堿完整生物合成通路始終未能被解析,成為制約其實現綠色、規模化、可持續化生物制造的核心瓶頸。

2026年6月12日 , 北京大學化學與分子工程學院、 北大 - 清華生命科學聯合中心雷曉光教授團隊 與中國農業科學院深圳農業基因組研究所閆建斌研究員團隊合作, 在Cell雜志上發表了題為 Complete biosynthesis of the anticancer cephalotaxinone and homoerythratine 的研究論文,首次闡明了兩類三尖杉抗癌生物堿的完整生物合成通路,并實現了異源重構研究團隊綜合運用多組學分析、化學合成、酶學表征、計算生物學與 點突變 等技術手段,發現并表征了三尖杉酮、高刺桐兩大關鍵生物堿的生物合成通路中核心催化反應酶,闡明同源細胞色素P450酶差異化催化的分子機制,并成功在本氏煙草中實現兩條合成通路的異源重構該項成果填補了三尖杉生物堿合成領域長期存在的知識與技術空白,為進一步利用合成生物學手段量產高三尖杉酯堿、保護瀕危藥用植物資源奠定了堅實基礎,是植物天然藥物生物合成與生物制造領域中的重大突破


研究團隊首先結合化學合成標準品,對三尖杉根、莖、葉不同組織開展代謝物定量檢測,明確生物堿 的 合成中間體主要在 根部合成富集 。隨后通過轉錄組與代謝組聯合分析、加權基因共表達網絡分析(WGCNA),創新采用 錨定酶篩選策略 ,以通路兩端功能明確的酶基因為切入點,從海量基因中逐步鎖定候選功能基因。經過大規模體外酶活實驗與植物瞬時表達驗證,團隊最終鑒定出 13個參與生物堿合成的關鍵功能酶 ,梳理出從芳香氨基酸出發,經多步氧化、還原、甲基化反應生成目標產物的完整代謝流程。系統發育分析進一步表明,三尖杉生物堿合成相關基因,主要由該物種特有的基因復制與功能分化演化而來,清晰揭示了整條通路的進化脈絡。

該研究 還 發現一對序列相似度高達91.6%的同源細胞色素 P450酶CfCYP2與CfCYP3利用同一中間體,卻通過差異化氧化反應,分別導向三尖杉堿通路與高刺桐堿通路,成為兩大分支的核心 “分子開關”。研究人員借助 AlphaFold 蛋白結構預測、分子動力學模擬、定點突變實驗,精準鎖定酶活性口袋內兩個決定催化選擇性的關鍵氨基酸殘基,闡明了同源酶功能分化的分子機理。這一發現刷新了人們對P450酶催化多樣性的認知,為解析植物次生代謝通路進化提供了經典范例。

在明確全部催化元件與反應順序后,研究人員分別組裝兩套核心酶基因組合,在本氏煙草中完成異源通路重構。經 LC-MS/MS 比對證實,煙草體系可穩定合成三尖杉酮 堿 與高刺桐 堿 ,產物與天然標準品高度吻合,成功實現了兩類抗癌生物堿人工合成路線的完整復刻。

該成果率先破解了困擾半世紀的三尖杉生物堿生物合成難題,不僅在基礎理論層面完善了裸子植物生物堿合成、酶功能進化的科學體系,更在應用層面打通了高價值抗癌生物堿綠色生物制造的技術鏈路。依托本次建立的技術體系,未來有望搭建微生物細胞工廠、工程化植物平臺,擺脫對瀕危三尖杉的依賴,大幅降低抗癌藥物生產成本,讓更多患者受益。


圖1 三尖杉酮堿和高刺桐堿生物合成通路解析

北京大學雷曉光教授 和 中國農科院基因組研究所 閆建斌 為 論文的共同 通訊作者, 北京大學博士畢業生田潤澤、基因組所博士后林非凡、北京大學博士生郭念昕和北京大學博士生劉宸玓 為該論文的共同第一作者。 北京大學博士后陳愷騏、北京大學博士生韓云晰、蘭銳昀和深圳灣實驗室李強博士也在底物合成、蛋白表達、理論計算等方面提供了重要幫助。

原文鏈接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00656-2

制版人: 十一

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