CryoSeek是一種研究策略,它采用冷凍電子顯微鏡(cryo-EM)從可獲得的來源中發現生物實體,并輔以人工智能輔助的數據處理和生物信息學分析。
2026年4月20日,深圳醫學科學院/清華大學顏寧、清華大學李張強、王彤彤共同通訊在Cell Chemical Biology在線發表題為“CryoSeek identification of glycofibrils with diverse compositions and structural assemblies”的研究論文。該研究使用CryoSeek策略報告了5種以前未表征的糖纖維的cryo-EM結構,揭示了不同的組成和組織特征。值得注意的是,TLP-0是一種只有聚糖的原纖維。結構分析表明,聚糖介導的相互作用對于糖纖維裝配至關重要,突出了聚糖在這些獨特的生物分子結構中的關鍵結構作用。
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碳水化合物是地球上最豐富的有機分子,是所有生物體必需的四類基本生物分子之一。它們在廣泛的生物學活動中發揮作用,例如作為大多數物種的主要能源、參與細胞構建、轉導信號以及調節蛋白質和核苷酸的折疊與功能。結構生物學的最新技術進展極大地拓展了人們對蛋白質的認識。然而,由于缺乏高分辨率的聚糖結構,結構生物學尚未對碳水化合物的生物學表征提供任何重大見解。
聚糖結構生物學的技術挑戰源于單糖組成的多樣性、分支的復雜性以及多糖的構象柔性。因此,高分辨率結構主要是在簡單組成的單糖-寡糖或與蛋白質結合的糖,或O-連接或N-連接聚糖中有限數量的糖殘基上解析的。當引入一種非常規的研究策略CryoSeek時,在確定聚糖高級結構方面取得了偶然的突破。CryoSeek利用冷凍電鏡直接對來自自然來源或組織的極小處理樣本進行成像。
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機理模式圖(圖源自Cell Chemical Biology)
在此,研究人員報告了基于CryoSeek對從清華荷塘(TLP)分離出的更多糖纖維的表征,命名為TLP-0/2/3/4b/IPT,分辨率在3.0-3.5 ?之間。這些糖纖維均被密集的聚糖覆蓋,其中心蛋白組分的質量百分比各不相同。TLP-0完全沒有蛋白質,TLP-2和TLP-4b分別僅具有二肽或四肽重復序列的線性鏈;TLP-3的中心莖是由線性三肽重復序列組成的三聚體,而IPT(免疫球蛋白樣、叢蛋白和轉錄因子)是指構成TLP-IPT中心莖的串聯結構域。
聚糖介導的相互作用決定了缺乏折疊蛋白組分的糖纖維的結構組裝。該研究揭示了聚糖結構折疊的多樣性,增進了對聚糖結構的理解,并進一步證明了CryoSeek作為一種以結構為先的發現范式。
參考消息:
https://www.cell.com/cell-chemical-biology/fulltext/S2451-9456(26)00078-4
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