2026年5月23日，由廣東省精準醫學應用學會主辦，臨床生物信息分會、中山大學孫逸仙紀念醫院細胞分子診斷中心承辦的“第八屆逸仙臨床生信培訓班”進入第三天的課程。在經歷前兩日密集的專題學習與深入交流后，學員們在知識碰撞與思想啟發中收獲頗豐。第三天課程延續高水準日程，迎來匯聚國內外權威專家的“大咖論壇”，吸引來自全國23個省、市及特區200余名分子診斷領域專家學者參會。

上午場：大咖論道，深入解析生信要點

廣東省精準醫學應用學會常務副會長兼秘書長孫炳剛，中山大學孫逸仙紀念醫院黨委書記楊建林，國家臨檢中心首席專家李金明教授，美國加州大學圣地亞哥分校宋偉教授，復旦大學腫瘤醫院周曉燕教授，廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、廣東省中醫院鄭廣娟教授，廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、暨南大學附屬第一醫院陸元志教授，廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、深圳市婦幼保健院劉文蘭教授，廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、廣東省人民醫院張慶玲教授等專家出席開幕式。開幕式由廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會主任委員、中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太教授主持。

廣東省精準醫學應用學會常務副會長兼秘書長孫炳剛為開幕式致辭

中山大學孫逸仙紀念醫院黨委書記楊建林線上致開幕辭

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會主任委員、中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太教授主持開幕式

上午場會議由中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太、廣東省人民醫院張慶玲、廣東省中醫院鄭廣娟、中山大學孫逸仙紀念醫院付莎、中山市人民醫院孫世珺、中山大學孫逸仙紀念醫院張寅六位教授共同主持。

國家臨檢中心首席專家李金明教授作《腫瘤基因突變高通量測序生物信息學及方法性能確認》報告，圍繞腫瘤基因突變NGS生信分析及方法性能驗證展開講解。作為腫瘤基因突變檢測的重要工具，NGS與明確檢測基因的PCR方法存在顯著差異——不僅伴隨診斷標志物涉及的基因數量持續增加，新靶標和藥物也不斷涌現。他指出，目前國內多數實驗室雖已開展LDT，但在性能確認方面仍面臨不小挑戰。李教授認為應從濕實驗和干實驗兩個層面分別進行性能確認，既涵蓋引物探針、精密度、分析靈敏度等分析層面的要素，也需明確測序深度、陰陽性判定、cut-off值等質量標準。他還分享了國家臨檢中心在生信性能確認方面的寶貴經驗，如通過計算機模擬測序流程、修改指令以驗證是否存在特定index錯配等。他強調，不同樣本類型需分別開展性能確認，陰陽性判斷也應科學設定閾值。

國家臨檢中心首席專家李金明教授

討論環節中，學員們意猶未盡地圍繞臨床生信資質、特殊樣本處理及質控等實際工作中亟待突破的難題展開熱烈交流。

討論環節

加州大學圣地亞哥分校臨床基因組學和分子病理中心宋偉教授帶來《十三年在美臨床分子病理行醫感悟》。作為實驗室中心主任，他負責報告簽發、檢測panel選定以及推動臨床醫生接受新技術。宋教授回顧了分子病理的發展歷程：從起源于尸檢，到伴隨新技術不斷演進，WHO第三版分類則帶來了規范模式的根本性改變。他還特別致敬了Fred Sanger等一代測序發明者對行業發展的重大推動。

宋偉教授介紹道，美國第三方檢驗實驗室占63%市場份額，醫院和診所約占36%，總體規模達28.5億美元，全國約有350家NGS實驗室。面對醫保不確定性、醫院決策層認識不足及第三方競爭激烈等挑戰，他坦言行業仍任重道遠。此外，宋教授又分享了美國醫師培訓路徑：4年本科、然后4年醫學院、再3—4年住院醫師培訓及1年專科培訓，分子病理醫生還有特定的考試與培養體系。他還提及其所在實驗室每年處理近1.7萬樣本，開展82個檢測項目，業務量持續增長。

加州大學圣地亞哥分校臨床基因組學和分子病理中心宋偉教授

授課結束后，學員們踴躍向宋偉教授提問，并深切感受到中美分子病理體系差異。美國市場的成熟與挑戰為學員提供了寶貴參照，也激勵了學員們在臨床生信之路上不斷開闊視野、精進本領。

討論環節

復旦大學附屬腫瘤醫院周曉燕教授分享《從數據到診斷－－如何發出一份可信任的NGS報告？》報告。她立足實際工作，圍繞NGS報告的全流程質控、結果處理及分析要點展開深入講解。她首先明確了可靠報告的核心要求，即結果準確、信息全面、報告及時且全程可溯源。在此基礎上，污染監測是質控的第一道關口：通過實驗室參考品、SNP指紋分析配對樣本，以及非配對樣本中低頻相同突變與臨床病理不符時重復檢測等手段，嚴把質量關。而對于低頻突變、拷貝數異常或融合等證據不充分的變異，則需借助IGV進行核對，并輔以其他方法驗證。

緊接著，周教授結合真實案例，指出流程優化的關鍵所在。 例如，胃腸道間質瘤因軟件參數問題漏檢長片段缺失；MSI-H病例的大panel未報拷貝數改變；融合基因檢測因質量差未能篩出融合基因。這些案例說明，持續優化生信流程是提升檢出率的必要舉措。此外，陰性結果同樣值得重視，需從基因涵蓋、樣本質量、生信流程等方面合理解釋原因。

而在結果分析與報告環節，周教授進一步區分了不同變異類型的處理策略。 胚系變異需結合家族史進行致病性分析，體細胞變異則要明確其臨床意義。針對VUS這一常見挑戰，她特別指出其對患者影響較大，報告必須結合臨床病理綜合判斷。最后，報告規范應遵循固定模板，體現共識內容與具體建議。

復旦大學附屬腫瘤醫院周曉燕教授

學員們在討論環節圍繞各自科室的具體問題向周曉燕教授虛心請教，學習熱情高漲。通過這節課，學員深刻體會到每一份報告背后都是對精準與責任的極致追求。唯有嚴控細節、不斷優化流程，方能真正為臨床決策保駕護航。

討論環節

暨南大學附屬第一醫院陸元志教授帶來《乳腺癌PAM通路臨床生信解讀》。陸教授圍繞乳腺癌診療的最新進展，從關鍵藥物、基因變異分類、檢測建議及真實臨床案例系統闡述了PIK3CA-AKT-mTOR信號通路在乳腺癌中的關鍵作用及其臨床轉化價值。

他首先從基礎研究切入，回顧了PAM通路的發現歷程及靶向藥物研發的成功路徑，并詳細解析了該通路調控細胞生長、增殖與代謝的核心機制，強調其在乳腺癌發生發展中扮演的重要角色。

隨后，陸教授聚焦臨床實踐，介紹了當前乳腺癌分子檢測的主要技術方法，并指出質量控制是確保結果準確、可靠的關鍵環節。在基因變異與分類方面，體細胞變異按致癌性分為一至三類，依據藥物獲批情況而定。不同類型的乳腺癌對特定變異的用藥建議也有顯著差異。

結合真實病例，陸教授深入解讀了PAM通路不同變異形式對臨床診療路徑及患者管理策略的具體影響，向學員展示了分子分型指導下的個體化治療價值。

最后，陸教授對未來分子檢測技術的推廣應用及靶向藥物的臨床前景進行了展望，呼吁加強多學科協作與生物信息學能力建設，以推動乳腺癌精準醫學的持續發展。

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、暨南大學附屬第一醫院陸元志教授

本節報告內容豐富、理論與實踐并重，不僅為學員們提供了前沿視角與實用指導，還讓大家深刻認識到基因檢測已深度融入乳腺癌全程，臨床生信人員需精準梳理報告信息、解析變異意義、合理選擇檢測范圍，才能更好地助力臨床決策。

討論環節

深圳市婦幼保健院劉文蘭教授帶來了《WES變異解讀的重點與難點分享》，就全外顯子測序變異解讀重點難點進行專題分享。他首先簡單介紹了深圳婦幼保健院WES的檢測數據，包括樣本量、家系檢測率，還有不同系統的檢出率。接著，他指出WES解讀的幾個難點：一方面是數據庫更新滯后帶來漏檢的風險，他強調單一數據庫遠不足以評估變異，需要交叉查詢不同數據庫，并結合表型與臨床醫生充分溝通，指出實驗室應建立基于文獻的內部基因－表型評估體系、并經常更新，是提升解讀質量的重要方向；另一方面是VUS的解讀難題，劉教授結合不同的案例，分享其實驗室關于VUS處理的寶貴經驗，如新增表型重分析，結合家系證據做風險評估等，為產前決策提供了關鍵依據，令學員深受啟發。

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、深圳市婦幼保健院劉文蘭教授

WES不是萬能，WES變異解讀也絕非單純的打分，而是一場多證據整合、多學科協作的系統工程。每一份報告背后都承載著一個家庭的期待，唯有不斷積累、保持審慎、持續更新，才能讓冰冷的測序數據真正轉化為溫暖的臨床幫助。

討論環節

上午的“大咖論壇”在熱烈研討與交流中落下帷幕。中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太教授在論壇總結中，由衷感謝各位分子領域專家圍繞質控、國際經驗、報告解讀、乳腺癌診療及遺傳病分析等方向傾囊相授，為培訓班學員開闊了眼界、帶來了深刻啟示。

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會主任委員、中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太教授做會議總結

上午論壇前沿的學術觀點與豐富的經驗為全體學員打開了思路，也讓大家對臨床生信工作中的變異解讀、報告規范等核心痛點有了更深刻的認識。前沿的研討為臨床實踐指明了方向，而標準化的操作規范正是將這些思路落地的關鍵。

上午場主持風采：

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會主任委員、中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太教授（左），廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、廣東省人民醫院張慶玲教授（右）

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會常務委員、中山大學孫逸仙紀念醫院付莎教授（左），廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、廣東省中醫院鄭廣娟教授（右）

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會常務委員、中山大學孫逸仙紀念醫院張寅教授（左），廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會副主任委員、中山市人民醫院孫世珺教授（右）

下午場：指南賦能，系統掌握變異分類

下午課程聚焦“體細胞變異分類基礎” ，圍繞致癌性分類與臨床意義分類兩大核心展開授課，內容涵蓋ClinGen指南、AMP指南、常用數據庫（如OncoKB、ClinVar）的使用，以及功能證據、預測性證據和癌熱點等關鍵證據類型的實踐應用。

中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太教授首先帶來《體細胞變異分類ClinGen指南簡介》，他通過系統介紹2022年發布的ClinGen腫瘤體細胞變異分類指南，為學員梳理了從變異識別到臨床決策的完整分析流程。

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會主任委員、中山大學孫逸仙紀念醫院歐陽能太教授

歐陽教授特別強調了體細胞變異分類報告規范在腫瘤檢測中的重要性，指出應首先進行致癌性分類。自2022年起，國內逐步采用ClinGen指南，其核心分析流程包括變異識別、注釋、致癌性分類、臨床意義分類及臨床決策五個環節。其中，致癌性分類針對熱點變異，可直接認定其致癌性；對于非熱點變異，參照證據打分體系，分為致癌、可能致癌、意義不明、可能良性、良性五類。值得注意的是，致癌性分類自動分析尚不成熟，需臨床生信員們審慎判斷。而對于臨床意義分類，依據FDA批準藥物及專業指南證據級別，確保報告準確反映變異對臨床決策的影響。同時，報告應明確藥物僅為分類證據，不作用藥推薦。最終臨床決策依托MTB多學科討論，由臨床腫瘤醫生、分子病理醫生、腫瘤生物學家、生物信息學家等，共同達成最佳臨床決策，制定規范化個體化診療方案。

通過這節課，學員更加深刻認識到熟練掌握權威分類指南、重視臨床生信分析和多學科協作，是將測序數據真正轉化為臨床價值的關鍵所在。

中山大學孫逸仙紀念醫院廖健偉教授通過解讀《腫瘤基因變異臨床意義分類AMP指南簡介》，著重介紹了AMP指南于2017年由三大權威機構聯合制定，旨在統一腫瘤檢測報告標準，打通與臨床之間的溝通壁壘。

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會常務委員、中山大學孫逸仙紀念醫院廖健偉教授

廖教授表示在臨床意義分類方面，主要依據FDA批準的靶向藥物及專業指南證據等級，將變異分為四類：

I類變異：強臨床意義（具有A級或B級證據）

Ⅱ類變異：潛在臨床意義（具有C級或D級證據）

Ⅲ類變異：意義不明確（VUS）（臨床結論不明確）

Ⅳ類變異：良性/可能良性（不報告）

對應的證據等級分為四類：

A級：可作為FDA批準治療某種特異性腫瘤的生物標志物，或被收錄于某些特殊類型腫瘤的診斷、治療、預后評價的權威指南。

B級：較大規模的臨床研究證實，且取得臨床專家共識。

C級：在其他癌種中的A級證據，或者已作為臨床試驗的篩選入組標準，或者有多個小型研究支持。

D級：臨床前研究，或者是病例報道支持。

通過幾例臨床案例，廖教授為大家詳細展示了臨床意義分類的應用，有效幫助學員們厘清了思路。他還強調在報告實踐中需特別注意：同一基因突變在不同癌種中分類可能不同；應遵循先基因后疾病、按證據級別分類的原則；高突變豐度且無正常對照時，建議進行胚系驗證；報告應同時呈現分類及依據，并借助數據庫與生信軟件輔助判斷。

廖教授也表示新版指南預計今年二季度或三季度將會推出，將進一步細化變異分類及生物標志物以及報告規范。

學以致用，準確理解并運用AMP指南，是確保腫瘤基因報告臨床價值、真正服務患者的關鍵所在。

中山大學孫逸仙紀念醫院付莎教授圍繞OncoKB 與 ClinVar 兩大數據庫的實操應用展開詳細講解，為學員們在查找證據時提供了實用工具。

廣東省精準醫學應用學會臨床生物信息分會常務委員、中山大學孫逸仙紀念醫院付莎教授

付教授介紹，OncoKB由MSKCC開發，專注于腫瘤體細胞變異的臨床可操作性，聚焦變異與治療方案的關聯，不僅可實現基因位點、突變類型、腫瘤病種、靶向藥物等多維度精準檢索，其證據等級涵蓋治療與耐藥，還具備高效批量變異注釋、變異臨床價值研判等實用功能，臨床指導實用性極強，數據庫近期新增多種藥物推薦，支持泛癌種標志物。但2026年起網站需注冊使用，學術交流部分權限免費，且數據側重歐美人群（OncoKB：https://www.oncokb.org/）。

而ClinVar（ClinVar：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ ）是NCBI維護的免費數據庫，其整合了多個數據庫，全面收錄人類胚系遺傳變異與腫瘤體細胞變異相關數據。支持精準檢索和數據批量下載，方便臨床生信分析人員整合分析，還可橫向對照多方研究結論，有效核驗不同來源下基因變異分類判定的一致性與規范性。查詢時需注意參考序列，其星級評審機制可評估證據可信度，星級越高結論越可靠。該庫覆蓋全面、免費開放、證據可溯源，但體細胞變異內容有待完善。

付教授對兩個數據庫進行對比總結，ClinVar每兩周更新，側重胚系變異；OncoKB每三個月更新，適合體細胞治療指導。學員們可根據場景靈活選擇。

中山大學孫逸仙紀念醫院蔣圓玲、黃永勝等老師分別聚焦功能證據OS2的使用、預測性證據OS1與OM4的使用以及癌熱點及其它證據的使用進行授課，系統覆蓋了體細胞變異解讀從指南依據、工具使用到不同證據層級應用的全流程。

蔣圓玲老師圍繞功能證據OS2及其應用展開深入講解，為學員在變異致癌性評級中提供了實操指導。她表示，一個well-established功能實驗需滿足：實驗設置合理、具備生物學相關性、經多個獨立實驗室驗證結果一致且實驗類型符合致癌性評估要求。

中山大學孫逸仙紀念醫院蔣圓玲老師

蔣老師以BRAF、EGFR基因為例，實際講述了OS2的使用過程中的升降級規則。她還介紹了OS2與其他證據（SBS2\OS1\OM1）的聯動，并提醒：使用OS2前需確認功能實驗針對堿基變異；高分文獻不等同于well-established實驗，需仔細評估設計與對照；不可將OP1誤用為OS2。而操作流程上，建議優先使用OncoKB和ClinVar檢索，再手動查PubMed，進行質量評估、強度判定并做好記錄。

功能實驗證據的審慎解讀是變異致癌性分類的基石，唯有嚴謹評估實驗質量，才能做出可靠的變異分類。

黃永勝老師圍繞腫瘤體細胞變異臨床解讀中的三類核心證據——腫瘤熱點、計算機預測及人群頻率進行了系統且深入的講解。

中山大學孫逸仙紀念醫院黃永勝老師

黃永勝老師首先對關于腫瘤熱點證據，明確將其劃分為三種類型：OS3、OM3與OP3，并結合具體基因變異實例加以說明。此外，這三類證據各自均有相應的使用注意事項（如適用條件、證據等級限制等），需在實際判讀中謹慎對待。其次，在計算機預測證據方面，涵蓋OP1、SBP1、SBP2等主要類型，并強調一個關鍵原則：即便采用多個不同的計算機預測工具，這些工具產生的結果僅能合計作為一次證據使用，不可重復計數。最后，關于人群頻率證據，涉及OP4、SBVS1、SBS1等類型，推薦使用gnomAD數據進行頻率查詢與評估。

上午的大咖論壇讓學員受益匪淺，下午的課程同樣干貨滿滿、啟迪頗深，既有體細胞變異分類指南（ClinGen/AMP），更有各組證據使用及實操案例。各位講者專業嚴謹、案例設計精心，讓學員對致癌性分類與臨床意義分類的每一條證據項都有了更深刻的理解，而一步步的檢索、評估、聯動操作讓抽象的指南真正落地。一日精進，自大咖論道至體系拆解，從指南要義到證據研判，所思所悟皆為變異解讀筑牢根基。