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Cell子刊最新:這種常見維生素竟能教免疫系統(tǒng)分清腸道菌群“敵友”,重塑腸道免疫耐受

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  炎癥性腸病(IBD)的發(fā)病與腸道菌群免疫耐受喪失密切相關(guān)。現(xiàn)有治療聚焦于抑制過度免疫反應(yīng),未直接干預(yù)宿主與菌群的免疫對話。

  維生素D缺乏與IBD疾病活動度升高相關(guān),既往研究表明其可調(diào)節(jié)腸道菌群組成和免疫細胞功能,但維生素D如何通過調(diào)控免疫球蛋白(IgA和IgG)與菌群的結(jié)合來恢復(fù)免疫耐受,尚缺乏系統(tǒng)性研究。

  近日,來自斯坦福大學等機構(gòu)的研究團隊發(fā)表于Cell子刊Cell Reports Medicine的一項研究通過為期12周的維生素D干預(yù)試驗,結(jié)合IgA-seq、IgG-seq、單細胞轉(zhuǎn)錄組測序及免疫組庫測序等多組學技術(shù),首次系統(tǒng)揭示了維生素D在IBD患者中促進腸道免疫耐受的分子機制。

  

  標題

  一、研究背景

  IgA是胃腸道黏膜分泌的主要抗體,通過與共生菌結(jié)合,在維持腸道免疫穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。而IgG與腸道菌群的結(jié)合則與腸道炎癥密切相關(guān),可激活Fcγ受體介導(dǎo)的炎癥通路。

  在IBD患者中,IgA和IgG與菌群的結(jié)合模式異常,且與疾病活動度相關(guān)。然而,目前尚缺乏調(diào)控Ig結(jié)合菌群的臨床策略。

  維生素D作為一種安全、易干預(yù)的營養(yǎng)素,既往研究已發(fā)現(xiàn)其可調(diào)節(jié)腸道菌群多樣性、增強有益菌豐度,并對B細胞和T細胞產(chǎn)生免疫調(diào)節(jié)作用。維生素D可抑制B細胞增殖和漿細胞分化,誘導(dǎo)調(diào)節(jié)性T細胞分化,并調(diào)控腸道歸巢整合素α4β7的表達。

  然而,維生素D能否通過調(diào)控Ig與菌群的結(jié)合來恢復(fù)免疫耐受,這一問題尚未得到解答。

  本研究旨在探究維生素D對IBD患者IgA和IgG結(jié)合腸道菌群的影響,并結(jié)合單細胞轉(zhuǎn)錄組和免疫組庫測序,揭示其潛在的細胞和分子機制。研究假設(shè)為:維生素D通過增強IgA與有益菌的結(jié)合、減少IgG與促炎菌的結(jié)合,并誘導(dǎo)α4β7+調(diào)節(jié)性免疫細胞,從而恢復(fù)腸道免疫耐受

  

  摘要總結(jié)

  二、方法與結(jié)果

  1.研究設(shè)計:48例IBD患者的12周干預(yù)

  本研究納入48例低維生素D水平的IBD患者(平均基線水平18ng/mL),其中潰瘍性結(jié)腸炎占56.3%,克羅恩病占43.7%。所有患者接受每周5萬單位口服維生素D,持續(xù)12周。研究收集了干預(yù)前后的血液和糞便樣本,用于多組學檢測。

  12周干預(yù)后,患者血清維生素D水平平均提升20ng/mL,糞便鈣衛(wèi)蛋白下降722μg/g,疾病活動度評分顯著改善(潰瘍性結(jié)腸炎下降3.2分,克羅恩病下降3.3分),生活質(zhì)量評分提升10.8分。

  值得注意的是,所有患者在干預(yù)期間均未發(fā)生藥物調(diào)整或新發(fā)抗生素暴露,排除了混雜因素的干擾。

  

  維生素 D 臨床試驗、樣本采集和處理概述

  2.Ig結(jié)合菌群的轉(zhuǎn)變:IgA增加,IgG減少

  維生素D干預(yù)后,糞便分泌型IgA水平顯著升高(+744.6 ng/mL),而糞便IgG水平呈非顯著性下降

  流式細胞分選結(jié)合16S測序顯示,維生素D使IgA-only結(jié)合菌群比例增加17.9%,使IgG-all結(jié)合菌群比例下降9.3%。在亞組分析中,這一趨勢在潰瘍性結(jié)腸炎和克羅恩病中均一致。

  

  維生素D可增加IBD患者腸道菌群中IgA的結(jié)合,同時降低IgG的結(jié)合

  相關(guān)分析顯示,IgA結(jié)合菌群水平與血清維生素D水平呈正相關(guān)(r=0.408),而IgG結(jié)合菌群水平與疾病活動度(r=0.447)和糞便鈣衛(wèi)蛋白(r=0.439)呈正相關(guān)。這提示IgA結(jié)合菌群的增加可能具有保護性,而IgG結(jié)合菌群則反映炎癥狀態(tài)。

  3.維生素D選擇性富集特定菌群

  在菌群組成層面,維生素D雖未顯著改變整體菌群α多樣性和β多樣性,但對IgA和IgG結(jié)合菌群產(chǎn)生了選擇性調(diào)控

  1)IgA結(jié)合菌群:維生素D增加IgA與LachnospiraceaeBlautia等產(chǎn)短鏈脂肪酸(SCFA)菌群的結(jié)合,同時減少與Proteobacteria等促炎菌群的結(jié)合

  2)IgG結(jié)合菌群:維生素D減少IgG與ProteobacteriaEnterococcaceae等促炎菌群的結(jié)合

  

  維生素 D 對 IgA 和 IgG 結(jié)合的腸道菌群的組成和預(yù)測的宏基因組功能具有不同的調(diào)節(jié)作用

  功能預(yù)測分析顯示,維生素D改變了IgA結(jié)合菌群的氨基酸代謝、碳水化合物代謝和脂肪酸代謝。這些代謝變化與腸道免疫調(diào)節(jié)密切相關(guān)

  4.BAFF信號通路激活

  單細胞RNA測序分析了37.5萬個外周血單個核細胞。維生素D干預(yù)后,雙陰性T細胞、cDC1樹突狀細胞、CD8效應(yīng)記憶T細胞增加,CD8初始T細胞和自然殺傷細胞減少。

  細胞互作分析顯示,維生素D增強了漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs)與B細胞亞群的相互作用。BAFF信號通路是唯一定位于pDCs與B細胞之間的通路,通過TNFSF13B-TNFRSF13C和TNFSF13B-TNFRSF17配體-受體對介導(dǎo)。體外共培養(yǎng)證實,pDCs和活性維生素D共同存在才能顯著增加IgA+B細胞比例,提示維生素D通過pDCs促進IgA類轉(zhuǎn)換。

  

  scRNA-seq揭示了維生素D對IBD患者外周血單核細胞(PBMC)組成以及樹突狀細胞與B細胞間信號傳導(dǎo)的影響

  5.BCR/TCR組庫重塑

  維生素D干預(yù)后,BCR和TCR克隆型數(shù)量呈增加趨勢,BCR中IGHA1同種型使用頻率顯著增加。差異分析識別出12個BCR和18個TCR克隆型發(fā)生顯著變化。

  

  scBCR-seq和scTCR-seq揭示了維生素D對免疫庫的影響以及與Ig結(jié)合的腸道菌群相關(guān)的共享BCR和TCR克隆型

  6.α4β7+調(diào)節(jié)性免疫細胞誘導(dǎo)

  維生素D干預(yù)后,α4β7+CX3CR1 B調(diào)節(jié)細胞顯著增加,初始B細胞減少。軌跡分析顯示其處于B細胞分化最末端。體外共培養(yǎng)證實,pDCs和活性維生素D共同存在才能誘導(dǎo)其分化。該細胞與IgG-Firmicutes正相關(guān),與IgA-Proteobacteria負相關(guān)。

  

  scRNA-seq揭示了維生素D調(diào)控的a4β7+B細胞異質(zhì)性和a4β7+B細胞免疫表型

  T細胞層面,維生素D增加α4β7+ T調(diào)節(jié)細胞(初始和細胞毒性),減少α4β7+γδ T細胞。T調(diào)節(jié)細胞與疾病活動度負相關(guān)(r=-0.8022),與IgG-Clostridiales、IgA-Lachnospiraceae正相關(guān),與Proteobacteria負相關(guān)。

  三、總結(jié)

  這項研究首次通過多組學整合分析,系統(tǒng)揭示了維生素D在IBD患者中促進腸道免疫耐受的機制。

  核心發(fā)現(xiàn)包括:維生素D選擇性增加IgA與有益菌(LachnospiraceaeBlautia)的結(jié)合,減少IgG與促炎菌(ProteobacteriaEnterococcaceae)的結(jié)合;通過增強pDC-B細胞BAFF信號促進IgA類轉(zhuǎn)換;重塑BCR和TCR組庫并建立與特定菌群的關(guān)聯(lián);誘導(dǎo)α4β7+CX3CR1 B調(diào)節(jié)細胞和α4β7+T調(diào)節(jié)細胞

  本研究的意義在于:第一,提供了首個前瞻性證據(jù),證明維生素D可通過調(diào)控Ig結(jié)合菌群恢復(fù)腸道免疫耐受;第二,通過多組學整合,描繪了宿主免疫-菌群互作的完整圖譜;第三,為IBD的“精準營養(yǎng)”干預(yù)提供了理論基礎(chǔ)。

  未來研究應(yīng)進一步探索維生素D誘導(dǎo)的調(diào)節(jié)性免疫細胞在IBD治療中的潛在應(yīng)用價值,以及不同維生素D水平對免疫耐受的劑量效應(yīng)關(guān)系。

  參考資料:

  [1]Gubatan J, Sojwal RS, et al. Multi-omics reveal vitamin D regulation of immune-gut microbiome interactions and tolerogenic pathways in inflammatory bowel disease. Cell Rep Med. 2026 Mar 26:102703. doi: 10.1016/j.xcrm.2026.102703.

  來源 | 梅斯學術(shù)

  撰文 |Catherine

  編輯 | VOX

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