想象一下 ——
你一遍又一遍跑膠到深夜,上樣、轉(zhuǎn)膜、孵抗體,每一步都反復(fù)檢查,但顯影時,條帶卻怎么都不對。你懷疑過操作,懷疑過樣品,懷疑過實驗設(shè)計,甚至最后你開始懷疑自己到底適不適合做科研。
但你有沒有想過,真正有問題的,可能是你手里那支從知名大公司買來、號稱已通過上百次檢驗,并且在上千篇論文中使用過的抗體。
這不是試圖嚇?biāo)酪粋€正在做 WB 的研究生的恐怖故事,而是正在上演的事實。
就在上周,Science報道了一起令人瞠目結(jié)舌的烏龍——因為買錯了抗體,數(shù)百篇文章的結(jié)論都受到影響。
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圖源:網(wǎng)絡(luò)
蛋白名稱鬼打墻,95% 的人買錯抗體
買錯抗體?聽起來像是剛進實驗室的小白會犯的錯。
但這篇Science報道揭露,這些買錯抗體的人分布在全球各地,不乏一些頂級科研機構(gòu)的大牛課題組,而用錯誤抗體的結(jié)果發(fā)表的文章從頂刊Nature到水刊Scientific Reports,已經(jīng)超過 300 篇。
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圖源:Science
讓我們從這一系列烏龍事件的暴露開始講起 ——
最近,知名職業(yè)學(xué)術(shù)打假人 Sholto David,開始注意到與蛋白p16-INK4a相關(guān)的造假現(xiàn)象格外嚴(yán)重。
p16-INK4a 是一個抑癌基因,更多的時候這個蛋白被用做細胞衰老和機體老化的標(biāo)志物。也就是說,能識別p16-INK4a蛋白的抗體,可以幫研究者定位產(chǎn)生該蛋白的細胞,并能指示細胞的老化程度。
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Sholto David 圖源:Science
這是一個非常經(jīng)典的衰老 Marker,已在數(shù)千項癌癥和衰老研究中得到驗證。于是也可以想象,市面上早有成熟的商品化抗體來滿足全球科研人的檢測需求。
于是,David 在發(fā)現(xiàn)這些研究有貓膩后,打開全球最大的抗體供應(yīng)商之一 Abcam 的網(wǎng)站,準(zhǔn)備搜索這個抗體,結(jié)果輸入蛋白名稱「P16」后,排在搜索第一位的「P16」抗體并不是 p16-INK4a,而是p16-ARC。這個和p16-INK4a 撞名的蛋白,跟衰老、腫瘤沒有半毛錢關(guān)系,而是一種幾乎在所有細胞里都廣泛、恒定表達的骨架蛋白。
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圖源:abcam 官網(wǎng)
不止 Abcam,同樣是試劑行業(yè)巨頭的 Thermo Fisher,搜索「P16」排在第一位的,也是那個細胞骨架蛋白 p16-ARC,而不是抑癌基因 p16-INK4a。
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圖源:Thermo Fisher
按理說,這不過是個「莞莞類卿」的撞名烏龍罷了,下單時多看一眼,或者往下滑一滑頁面,就能買到正確的抗體。
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可結(jié)果令人大跌眼鏡,David 用錯誤的「嬛嬛貨號」—— 細胞骨架蛋白P16-ARC 進行檢索時,發(fā)現(xiàn)使用了該貨號的論文共有 400 多篇,在能拿到全文的 334 篇里,只有 17 篇真正在研究 p16-ARC,其余 312 篇(還有 5 篇有其他錯誤)本意都是想研究「莞莞蛋白」——抑癌基因 P16-INK4a,也就是說,超過 95% 的研究者都買錯了抗體!
更離譜的是,這個錯誤最早可以追溯到十多年前的研究,但是卻一直無人察覺。
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圖源:forbetterscience 312 篇論文用錯了抗體
甚至 Abcam 官網(wǎng)的產(chǎn)品頁,還特地好心標(biāo)注:p16-ARC 抗體特異性結(jié)合 ARPC5 蛋白,有些文獻用錯了,請注意區(qū)分,因為該抗體與 P16-INK4a 不會交叉識別。但很顯然,上述的 95% 的研究者,都沒有打開產(chǎn)品說明書看過。
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圖源:abcam 官網(wǎng)
錯的抗體,做出了正確的結(jié)果
真正讓人啼笑皆非的,不是這么多人買錯了抗體,而是上述的大部分研究者,用著細胞定位和結(jié)構(gòu)功能全然不同的抗體,居然還都做出了「符合預(yù)期」的實驗結(jié)果。
其中就有知名科學(xué)家美國加州拉霍亞索爾克研究所首席科學(xué)官Jan Karlseder 2019 年發(fā)表在Nature上的論文:Autophagic cell death restricts chromosomal instability during replicative crisis,該論文聚焦于細胞周期,其中 p16-INK4a 是一個非常關(guān)鍵的調(diào)控因子。
而在他們的論文中,這個隨著細胞周期表達量顯著變化的「P16」條帶,正是用錯誤貨號的細胞骨架蛋白抗體做出來的。
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圖源:forbetterscience
被揭露后,Karlseder回應(yīng)稱,自己團隊實際購買的是正確抗體,只是寫論文的時候把貨號寫錯了,并已經(jīng)向Nature提交了更正。
如果說 WB 的條帶還有辯駁的余地,畢竟這兩種蛋白的大小確實恰好都在 16KDa 左右。
那有些論文就更沒法解釋了——他們直接用這支抗體做了免疫組織化學(xué)染色,并用這個染色結(jié)果去定義細胞的衰老過程,于是,一個定位在細胞骨架上的蛋白,又搖身一變,成為了指示細胞衰老情況的指標(biāo)。
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圖源:forbetterscience
我說的就是 2016 年,斯坦福大學(xué)知名科學(xué)家 Cornelia M Weyand 團隊發(fā)表在影響因子高達 33 的頂刊Immunity上的論文:Deficient Activity of the Nuclease MRE11A Induces T Cell Aging and Promotes Arthritogenic Effector Functions in Patients with Rheumatoid Arthritis Immunity。
不過最近 Weyand 團隊也已做出回應(yīng),承認用錯了抗體,但也表示不影響主要結(jié)論,并將對「為什么錯誤的抗體也能有陽性染色」進行下一步研究。
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圖源:Pubpeer
還有 300 多篇論文都犯了如此尷尬的低級錯誤,不一一列舉,只有少數(shù)作者進行了回應(yīng),也有四位作者早前因其他學(xué)術(shù)不端問題已被撤稿。
要用一支骨架蛋白抗體,穩(wěn)定復(fù)現(xiàn)出抑癌基因該有的結(jié)果,幾乎是不可能的事。也難怪 Daivd 在最初揭露此烏龍的文章中,把這種情況叫做「Mind over Antibody」,仿佛蛋白表達也已經(jīng)成為唯心主義。
皇帝的新衣
在這 300 多篇論文中,難道就沒有一個老實人,敢于指出皇帝身上那件新衣并不存在嗎?
好消息是,這樣的老實人作者有,而且還不止一位。
比如,復(fù)旦大學(xué)朱國英教授團隊 2020 年發(fā)表在American Journal of Physiology:Cell Physiology上的論文,同樣用了 P16 和其他幾個衰老 marker 基因,來指示輻照后的干細胞衰老的程度。
結(jié)果顯示,這個本該指示衰老的「P16」,沒有和其他的衰老 marker 一樣變化,反而是像圖片最下方,用于對照的骨架蛋白 β-actin 一樣,沒有因為實驗條件變化而產(chǎn)生一絲波動。
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朱國英教授團隊在論文中如實描述了這一問題,表述為 P53/p21 兩個衰老基因表達上調(diào),但 P16 沒有發(fā)生變化。如今看來,這個「沒有發(fā)生變化」恰好是 P16-ARC 作為一個穩(wěn)健的細胞骨架蛋白該有的真實情況。
但遺憾的是他們并未深究和討論這個異常現(xiàn)象,否則說不定就能發(fā)現(xiàn),這個異常只是因為買錯了抗體。
抗體鬧出的烏龍,這并不是第一次。
2024 年,一篇發(fā)表在cell death & disease上的文章直接質(zhì)疑 Santa Cruz Biotechnology 公司售賣的 BAX 蛋白抗體,識別到的根本就不是 BAX 蛋白,而這支抗體已被 1400 多篇論文使用過。
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圖源:cell death & disease
BAX 是細胞凋亡通路里的核心基因,一直被用作細胞凋亡的經(jīng)典檢測基因。這篇文章的作者做了一個簡單的驗證,直接將細胞里的 BAX 蛋白完全敲除,再用 Santa Cruz Biotechnology 公司的抗體去檢測,但仍能在相似的位置檢測到蛋白條帶。但是換用其他牌子的 BAX 抗體,就能看到 BAX 信號如預(yù)期般消失。
目前這支抗體仍然在 Santa Cruz Biotechnology 官網(wǎng)售賣,不過,評論區(qū)已有買家打出一星差評,指出它在 20–25 kDa 之間存在假陽性,并呼吁廠家停止銷售。
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圖源:Santa Cruz Biotechnology
比起「P16」的烏龍,這起事件對科研人來說或許更像恐怖故事——畢竟這已經(jīng)完全超出了一個科研人自己足夠小心,或者足夠誠實就能規(guī)避的范疇。
圈內(nèi)人士給這個情況起了個不留情面的外號——「抗體恐怖秀」(antibody horror show),而且由于現(xiàn)行生物研究方式的局限,對抗體的依賴性非常高,據(jù)估算,僅在美國,每年因為劣質(zhì)抗體造成的科研損失就高達 3.5 億美元。
所以下次 WB 條帶再不對時,先別急著懷疑自己,出問題的,很可能是你手中這支抗體。
參考來源:
1.https://forbetterscience.com/2026/06/02/mind-over-antibody/
2.https://journals.physiology.org/doi/full/10.1152/ajpcell.00520.2019
3.https://pubpeer.com/publications/1911FFDDEBA4EA8F79885AB53560DF#
4.https://www.science.org/content/article/protein-name-confusion-created-antibody-mix-affecting-hundreds-papers
5.https://cen.acs.org/research-integrity/Sleuths-say-Thermo-Fisher-doctored/104/web/2026/05
6.https://www.nature.com/articles/s41419-024-07273-6
題圖來源:圖蟲創(chuàng)意
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