真菌的有性生殖依賴于減數分裂過程中程序性DNA雙鏈斷裂的精確發生,這一過程的核心催化酶Spo11如果調控失當,既可能破壞染色體穩定性,也可能影響后代孢子的正常形成。2026年6月10日,西北農林科技大學劉慧泉教授團隊在《科學進展》雜志上發表了一項題為《Adaptive Spo11 RNA editing gate optimizes meiosis I pace and mitotic proliferation while preserving ascospore formation》的研究。西北農林科技大學 植保學院博士研究生吳夢春為論文第一作者,劉慧泉和王秦虎教授為論文共同通訊作者。在這項研究中,研究團隊通過對植物病原真菌禾谷鐮刀菌中FgSPO11基因的精準注釋和功能解析,發現了一個發生在提前終止密碼子上的發育階段特異性RNA編輯事件,該事件能夠精準控制功能性Spo11蛋白的合成時機與劑量,從而協調減數分裂進程、有絲分裂控制以及病原菌的營養生長的適應性。
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研究團隊首先糾正了先前基因組注釋中關于FgSPO11基因的錯誤拼接模型,他們通過全長轉錄組數據確認該基因第五外顯子實際上攜帶一個提前終止密碼子TAG,按照這個序列只能翻譯出一個僅有209個氨基酸的截短蛋白,并且這個截短蛋白完全缺失了C末端負責催化活性和蛋白互作的拓撲異構酶結構域。進一步分析有性生殖階段的轉錄組數據后,他們發現在受精后5到8天的子囊果中,這個終止密碼子能夠被高效編輯為色氨酸密碼子TGG,編輯水平在后期可以達到80%以上,從而產生全長414個氨基酸的功能性FgSpo11蛋白。研究團隊還驗證了這一編輯事件完全依賴于有性生殖階段特異性表達的Ame1蛋白,在ame1缺失突變體中所有編輯位點均消失,說明該調控機制是有性發育程序的一部分。
為了弄清楚這個編輯事件到底有多重要,研究團隊分別構建了不可編輯的FgSPO11TAA突變體以及模擬編輯后狀態的FgSPO11TGG突變體。他們發現不可編輯的突變體完全喪失了正常形成子囊孢子的能力,減數第一次分裂進程明顯加快并且減數第二次分裂出現異常,同時還出現了子囊孢子發生階段過度進行有絲分裂的現象,這些表型與FgSPO11完全缺失突變體幾乎一模一樣。而模擬編輯的突變體則能夠正常完成有性生殖,子囊孢子形態和數量與野生型沒有顯著差異,說明只有經過編輯產生的全長蛋白才具備功能。研究團隊還通過蛋白質免疫印跡實驗發現,未編輯的截短蛋白在細胞內極不穩定并且無法與互作蛋白FgSki8結合,幾乎檢測不到蛋白信號,而全長蛋白則可以穩定存在并正常參與蛋白復合物的形成。
進一步的功能分離實驗揭示出FgSpo11在減數分裂過程中扮演了兩個不同性質的調控角色。研究團隊構建了催化活性失活的FgSPO11Y129F突變體,該突變體仍然能夠正常進行減數第一次分裂和第二次分裂,說明延緩減數第一次分裂進程的功能并不依賴于Spo11的DNA雙鏈斷裂催化活性。但是在子囊孢子發生階段,這個催化失活突變體卻表現出了和缺失突變體一樣的有絲分裂過度增殖表型,說明抑制多余有絲分裂的功能必須依靠Spo11的切割活性。也就是說,同一個蛋白通過不同的分子機制分別控制了減數分裂的節奏和孢子形成階段的核分裂次數。
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由于這個突變體在所有發育階段都可以產生全長蛋白,研究團隊在營養生長的菌絲尖端觀察到了細胞核數量的明顯下降,說明了全長蛋白在營養生長階段是有毒性的。他們進一步證實這種毒性依賴于Spo11的切割活性以及同源重組修復通路中的關鍵重組酶FgRad51,在同時缺失FgRad51的情況下,FgSPO11TGG突變體的生長受到嚴重抑制并且對基因毒藥物更加敏感。這表明了編輯調控的一個重要作用就是防止功能性Spo11蛋白在營養生長階段泄漏表達,從而避免基因組因為不必要的DNA斷裂而遭受損害。
最后,研究團隊進一步分析了數百個子囊菌門真菌的SPO11基因的序列和RNA的二級結構預測,他們發現編輯位點對應的TGG色氨酸密碼子在許多類群中直接編碼在基因組里,而提前終止密碼子TAG則是在多個獨立譜系中反復出現的衍生狀態。此外,那些攜帶TAG密碼子的物種往往同時具備能夠支持編輯發生的RNA莖環結構,這些結果說明了這種通過RNA編輯來實現發育階段特異性調控的模式在不同真菌類群中可能經歷了趨同演化。
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