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MRD在抗癌治療中的實際應用思考與局限性

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作者:閔

MRD微殘留檢測已經不能再稱為一個新概念了,不僅相關檢測產品上市推廣已有數年,相關的文章也從早期患者拓展到晚期患者,從肺癌拓寬到腸癌、胃癌、乳腺癌等等,大有面向全體腫瘤患者的架勢。

然而面對不同的檢測策略,如何選擇仍是臨床中的實際難題。

本文以一個真實病例為引,對比分析當前主流的兩種MRD策略,并探討其在實際應用中的局限與思考。

1

檢測策略與技術的分野

我們作為普通病友,往往關注的是微觀具體的技術,而忽略了宏觀層面的策略。這兩者從不同維度影響著檢測這件事。

檢測技術如同“武器裝備”,決定了基礎性能;而檢測策略則是“戰術布局”,影響整體效果。

舉個例子,檢測技術就好像打仗時用的槍炮:有簡陋的小米加步槍,也有精良的現代化槍械,裝備的差距決定了火力的差距。然而,作戰并非只靠槍支彈藥,作戰部署同樣重要。是正面接戰,靠火力和人數取勝,還是迂回繞后、逐個擊破?不同的場景需要采用不同的戰術。檢測也是如此。

從技術層面來看,雖然各家檢測公司都陸續推出了自家的MRD檢測套餐,宣傳詞天花亂墜,但歸根結底,所用的檢測技術都是基于NGS(高通量測序,即二代測序),可能只是測序儀的平臺略有不同,底層技術已趨于同質化。

技術方法趨于同質化,那么差異就體現在戰術策略上了。



圖片來源:包圖網

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主流MRD策略解析

目前主流的MRD檢測策略可分為兩類:



MRD有兩種檢測邏輯:一種稱為腫瘤已知分析法(tumor-informed),另一種稱為腫瘤未知分析法(tumor-agnostic)。

前者通過先使用患者的組織樣本進行檢測,以檢測到的基因突變建立參考基線,后續的血液監測則以基線中發現的這些突變作為主要監測標簽。這種策略的出發點,是能夠精準跟蹤患者腫瘤組織中的突變。后者則不使用組織樣本檢測,也不建立基線,以“未知”的狀態直接用血液檢測,將檢測到的任何突變都納入監控范圍。該策略的出發點是以更廣泛的視角去監控隨訪期間可能出現的突變,同時也可以應對腫瘤樣本不可及的情況。

這兩種邏輯在檢測panel(即通常所說的包含多少基因的檢測項目)的制定上也有所區別。

腫瘤已知分析法較為標志性的做法是:先用包含基因較多的panel對患者的組織樣本進行檢測,然后根據檢測結果為該患者“個性化定制”專屬的panel,后續就用這個框定的范圍進行血液監測。

腫瘤未知分析法則不做這種個性化改動,而是用一套包含更多基因的固定panel,以不變應萬變,對每次檢測不設事先預期,以每次實際檢測到的結果為主。盡管腫瘤已知分析法在后續血液隨訪中也可以采用固定panel,但個性化定制更具代表性和標志性,也常被作為宣傳亮點。

我們再回到產品形式。

以目前市面上各種MRD套餐為例,如果套餐形式為“組織檢測一次 + N次血液檢測”,則采用的是腫瘤已知分析法;相應地,如果套餐形式僅為N次血液檢測,則采用的是腫瘤未知分析法。

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兩種檢測策略的差異

高樹庚教授于2021年發表的MRD術后隨訪研究采用的是腫瘤已知分析法策略,而吳一龍教授于次年發布的類似研究則兩種策略都有采用,只是更傾向于腫瘤已知分析法策略。從這一點來看,臨床上似乎更偏向于給術后患者采用腫瘤已知分析法策略,畢竟有現成的組織樣本可用。

2023年一項韓國研究比較了兩種策略在腸癌術后隨訪的表現[1]:

  • 腫瘤已知分析:82%患者術前血中檢出至少一個與組織相同的突變。
  • 腫瘤未知分析:僅34%患者術前血與組織結果重合。



另一個角度來看,全部38名患者的術后組織樣本中共檢測出61種基因突變,腫瘤未知分析組的術前血檢測到18種,腫瘤已知分析組術前血檢測到15種,剩余28種突變均未在術前血樣本中檢測到。

令人遺憾的是,研究者根據兩種策略的術前血結果,認為tumor-informed的靈敏度更高并在后續隨訪中全部采用此策略,未能進一步對比兩種策略的差異。后續隨訪時,MRD陽性患者的平均豐度為0.028%,有80%(8/10)的突變豐度低于該研究設定的tumor-agnostic檢測下限(0.1%),因此研究者推測tumor-agnostic策略可能會遺漏這部分陽性患者。

除了上述研究外,仍有其他一些研究及專家認為,腫瘤未知分析法策略在識別復發風險高的患者時,其靈敏度與腫瘤已知分析法策略相當,并且正因為其不依賴于組織樣本的信息,還能夠縮短檢測周轉時間并降低相關費用。

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現實案例引發的思考

或許有病友會疑惑:韓國的這項研究雖然沒有進一步對比隨訪階段的差異,但僅從術前血的檢測性能來看,腫瘤未知分析法策略的陽性率顯然不太理想,為什么還有專家認為兩種策略各有千秋、旗鼓相當呢?

我們可以通過筆者近期遇到的一個真實案例來探討這個問題。

  • 該患者基線組織檢出38個突變(含EGFR 19Del);
  • 前三次血檢陰性,第四次檢出12個突變(不含EGFR 19Del);
  • 約一年后確認復發,但希望用最后一次MRD分析耐藥基因時,因Panel僅限基線38個基因而無法實現;
  • 若想檢測復發耐藥原因需另外購買其他檢測服務;

此案例引發幾個關鍵疑問:

基線突變的價值是否等同?

如EGFR驅動突變與其他伴隨突變在復發預測中是否具有相同意義?畢竟案例中最后一次MRD檢測雖為陽性,但檢測到的12個基因中并不包括EGFR 19Del,而患者于近一年后發現復發;

類比一下,當檢查腫瘤標志物時,癌胚抗原正常,但胃泌素高或者糖類抗原125異常,它們代表的意義是否一樣?

復發時未檢出“關鍵”突變意味著什么?

比如沒有檢測到EGFR 19Del卻復發了,能說明新發的病灶不攜帶EGFR嗎,或者新發的腫瘤和最初的腫瘤組織已經有所區別?那假如有所區別,有沒有可能出現原本基線以外的其他新突變?

再用腫瘤標志物類比,比如當初確診時包括癌胚抗原、鱗狀細胞癌相關抗原等等多個標志物都有異常,等治療一段時間后,突然鱗狀細胞癌相關抗原高了,是否代表一定復發,或者是否說明復發的癌種已和以前不一樣?

個性化定制是否限制了測視野?

腫瘤未知分析法策略與腫瘤已知分析法——或者更準確地稱之為固定Panel與個性化定制Panel,它們互相的優缺點對后續監控會造成不一樣的困惑。

個性化定制后的Panel(近似腫瘤已知分析法)固然可以提升測序深度,提高檢測陽性的概率,但這是否在某種程度上忽略了腫瘤發生變異的可能性?最顯而易見的例子比如EGFR靶向耐藥后可能新增MET突變,而它大概率不會在基線狀態便存在。換句話說個性化定制Panel永遠不可能通過檢測到MET突變的方式來預警未來潛在的耐藥和進展。

腫瘤可能存在異質性,個性化定制策略是否會因此而產生個別假陰性結果?

固定Panel(近似腫瘤未知分析法)通常是包含上百個基因的固定大Panel。它覆蓋的基因數量通常多于個性化定制,減少了類似尷尬,但它不僅在測序深度及單次陽性率方面不及個性化定制,而且仍然擺脫不了靈魂拷問——“我真的做夠數量了么,會不會還有遺漏?”



圖片來源:包圖網

5

總結

當前MRD策略面臨兩大矛盾:

腫瘤已知分析:精準但“視野窄”,個性化定制后的Panel固然可以提升測序深度,提升檢測陽性的概率,但是否一定程度上忽略了腫瘤的變異可能,可能漏掉進化后的新突變。

腫瘤未知分析:覆蓋廣但“深度淺”,包含上百基因的固定Panel雖然覆蓋的基因更多,不易出現個性化定制的這種尷尬,但可能漏檢低豐度陽性信號。

這背后是一個更根本的問題:我們應在多大程度上“信任”基線腫瘤的基因特征? 腫瘤是動態進化的,過度依賴歷史信息,可能無法預見未來。

通過最近遇到的一個案例,我想到了兩種常用MRD隨訪策略之間的爭議,因此寫下這篇拙作,供大家討論。

最后提醒一句:無論是否做MRD,都希望大家能夠認識到影像學作為最客觀證據的重要性,一定要定期進行CT、核磁等影像學檢查。

參考文獻

[1]. Chan H T, Nagayama S, Otaki M, et al. Tumor-informed or tumor-agnostic circulating tumor DNA as a biomarker for risk of recurrence in resected colorectal cancer patients[J]. Frontiers in Oncology, 2023, 12: 1055968.

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