相信絕大部分小伙伴都曾想過「如果不吃不喝,我能長期生存下去嗎?」深海中有著這樣一群生物:體長半米,卻能做到「吃一頓飯,管飽五年」。這背后究竟隱藏著怎樣的進化奇跡?
2019 年,中國科學(xué)院海洋研究所李富花研究員團隊利用蝦基因組破譯了蝦適應(yīng)海底生活和頻繁蛻皮的遺傳基礎(chǔ)(Nat Commun,2019.1.21),2025 年底,他們通過單核 RNA 測序,在蝦中發(fā)現(xiàn)了一種功能與脊椎動物淋巴器官驚人相似的細胞結(jié)構(gòu),這一發(fā)現(xiàn)引發(fā)了關(guān)于無脊椎動物是否也進化出免疫器官的爭論(J Adv Res,2025.11.15)。2026 年,該團隊又提出了另一個令人驚訝的發(fā)現(xiàn):抑制脊椎動物肌肉生長的 GDF8 已經(jīng)轉(zhuǎn)變?yōu)榭焖偌铀傥r生長的生長因子 (Int J Biol Macromol,2026.4.25)。這些研究收集了大量有關(guān)甲殼類動物基因組和表觀遺傳學(xué)的數(shù)據(jù),為后來闡明深海貝類的「生存悖論」奠定了基礎(chǔ)。
最新研究
昨日,中國科學(xué)院海洋研究所實驗海洋生物學(xué)實驗室李富花、相建海團隊聯(lián)合香港中文大學(xué)的朱嘉濠團隊在 Cell 上發(fā)表最新成果,該研究通過研究深水種等足類生物:深海水虱,解答了這一問題。
![]()
圖 1:文章來源(Cell)
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(26)00571-4
這種生物體型巨大(長達半米),但僅靠一頓飯仍能存活五年以上,這代表了一種神奇的「能量悖論」,盡管在深海幾乎沒有食物,龐大的身體卻快速消耗能量。研究人員首次根據(jù)經(jīng)驗觀察到,深水種等足類進化出了兩種策略:第一種是將胃巨大擴大到體腔的三分之二左右,這使它們能夠大量進食,第二種策略是基礎(chǔ)代謝急劇減慢,檸檬酸合酶和乳酸脫氫酶的活性下降,活性氧和 NADH/NAD+ 的比例也下降,與線粒體氧化磷酸化有關(guān)的基因簇明顯減少。
![]()
圖 2:棲息于不同深度的等足類動物
但這些內(nèi)部調(diào)整還不夠,終于研究人員在基因組中發(fā)現(xiàn)了一個關(guān)鍵線索:ND1 基因。該基因是線粒體復(fù)合體 I 亞基的一部分,但本身深水種等足類最初并不擁有它。他們很久以前通過「水平遷移」從衣原體等細菌那里遺傳下來,在深海群體中這種 ND1 基因已經(jīng)復(fù)制了多達五次,其中四個拷貝具有極高的表達量,它屬于所有基因中最活躍的 1%,在胃、肝胰腺、神經(jīng)和肌肉等組織中被廣泛復(fù)制。但生活在淺水區(qū)的物種擁有該基因的拷貝數(shù)較少,其表達量較低,幾乎完全無活性。
![]()
圖 3:兩種等足類動物中 ND1 水平轉(zhuǎn)移基因的系統(tǒng)發(fā)育樹
進一步研究發(fā)現(xiàn),ND1 的這種過度表達通過基因啟動子區(qū)一種稱為組蛋白乙酰化(H3K9ac)的機制被高度激活,宿主對此做出反應(yīng),并使參與乙酰化的酶的數(shù)量大幅增加。為了證實 ND1 的重要性,研究小組創(chuàng)造了轉(zhuǎn)基因斑馬魚,在 27°C 的室溫下喂食 ND1 的魚表現(xiàn)出比平時明顯更高的能量代謝,但當水溫降至 18°C 時,與深海底部的溫度相似,攜帶 ND1 的個體即使在饑餓狀態(tài)下存活時間也明顯更長(高達 37%!),且他們的體重幾乎沒有下降,原因是其耗氧量適中,更進一步的說便是 NADH/NAD+ 比率和略微升高的活性氧濃度保持穩(wěn)定。
![]()
圖 4:通過組蛋白乙酰化對 ND1 超高水平表達的特異性調(diào)控
尾聲
在本研究中,作者使用斑馬魚、線蟲和細胞模型來研究 ND1 的功能。不幸的是,這些模型無法完美再現(xiàn)高壓(約 10 MPa)和低溫(約 4°C)的現(xiàn)實環(huán)境。ND1 的確切分子信號通路尚未完全闡明。雖然之前的研究主要集中在內(nèi)源性基因的擴增上,但發(fā)現(xiàn)的 ND1 是一個從外部來源水平轉(zhuǎn)移并通過表觀遺傳機制過度表達的基因 —— 這是一個極其罕見的案例,即使在后續(xù)臨床應(yīng)用中使用 ND1 來調(diào)節(jié)人類代謝,也會面臨三大挑戰(zhàn):不同物種之間的基因轉(zhuǎn)移是否功、外源基因是否會引發(fā)免疫反應(yīng)以及室溫下代謝是否會過度激活。然而,對本土實驗室啟發(fā)的角度來看,這項研究顯示了一個有希望的模型,在不作為模式生物且生活在極端環(huán)境中的生物中發(fā)現(xiàn)進化創(chuàng)新,其有望取得比確認模式生物中已知代謝途徑更大的成功。其中最重要的基礎(chǔ)是整合基因組資源和多組學(xué)能力。
參考文獻:
1.Zhang X, Yuan J, Sun Y, Li S, Gao Y, Yu Y, Liu C, Wang Q, Lv X, Zhang X, Ma KY, Wang X, Lin W, Wang L, Zhu X, Zhang C, Zhang J, Jin S, Yu K, Kong J, Xu P, Chen J, Zhang H, Sorgeloos P, Sagi A, Alcivar-Warren A, Liu Z, Wang L, Ruan J, Chu KH, Liu B, Li F, Xiang J. Penaeid shrimp genome provides insights into benthic adaptation and frequent molting. Nat Commun. 2019.
2.Si S, Zhang X, Sun J, Sun W, Zhong X, Sun M, Hu J, Yuan J, Yu Y, Li S, Li F. Structural and functional analysis of growth differentiation factor 8: A positive regulator of growth in the Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei. Int J Biol Macromol. 2026 May;364:152224. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2026.152224. Epub 2026.
3.Sun M, Li S, Liu Y, Li F. Single-nucleus RNA sequencing illuminates a functional analog of lymphoid organ in crustacean. J Adv Res. 2025.
4.Yuan JB, Zhang XJ, Li FH. Deep-sea megafauna co-opts microbial energy metabolism genes to withstand ultra-long starvation. Cell. 2026.
特別聲明:以上內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))為自媒體平臺“網(wǎng)易號”用戶上傳并發(fā)布,本平臺僅提供信息存儲服務(wù)。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.